Gli obiettivi formativi del corso mirano alla specializzazione degli allievi nei diversi settori tematici e cronologici previsti dai sei curricula attivati. Lo scopo è quello di formare e addestrare alla ricerca scientifica i migliori laureati nelle discipline dell’area archeologica spaziando dalla preistoria al medioevo attraverso l’etruscologia e il mondo classico senza trascurare le antiche civiltà del Vicino e Medio Oriente.
I corsi vengono organizzati in modo da poter focalizzare il lavoro dei dottorandi sulla metodologia pratica e teorica della ricerca: in particolare gli obiettivi, i metodi di svolgimento, l’esame critico dei materiali oggetto di studio e dei primi risultati realizzati.
L'avvio e l'esercizio di una cosciente critica della propria produzione è considerato un momento essenziale del corso da esercitare attraverso la comparazione, il confronto critico e organizzativo con quanto è stato pubblicato sull'argomento della ricerca dei dottorandi. L'obiettivo principale è di istruire i giovani che intendono coltivare gli studi sul mondo antico sia nella metodologia che nella prassi della ricerca, in modo da condurli a produrre risultati scientificamente validi e tali da meritare di essere pubblicati, avviandoli ad occupazioni di elevata qualificazione.
Ogni studente della Scuola è infatti indirizzato a condurre una ricerca originale con lo scopo di giungere, sotto la guida di un tutor, alla pubblicazione finale della propria dissertazione.